長瀬さんの引継ぎ
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開始行:
[[引き継ぎ(中島)]]
目次
#contents
----
*目標 [#he736473]
データ数を2つ集め併せて計4つほど程度増やしてRF6.2で出力を...
*データの収集 [#tf106502]
統計で見る日本というサイトで,2020年の外国人数と小学校数(...
csvファイルをダウンロードする.
#ref(0229_02.png,,30%)
#ref(0229_03.png,,30%)
#ref(0229_04.png,,30%)
#ref(0229_05.png,,35%)
#ref(0229_06.png,,30%)
*使ったプログラムとデータ [#j6630b36]
#ref(RF6_real_experiment100.py,,RF6_real_experiment100.py)
#ref(data-city_num.csv,,data-city_num.csv)
#ref(open-data-20240220T010622Z-001.zip,,open-data-202402...
#ref(data-20240220T010624Z-001.zip,,data-20240220T010624Z...
#ref(LPA.R,,LPA.R)
#ref(k-means_0205_3.py,,k-means_0205_3.py)
*データの整理 [#r984c834]
ダウンロードしたopen-data-20240220T010622Z-001の中にあるo...
その際に,1741のデータから651のデータを抜き取ること.どのデ...
#ref(0229_07.png,,30%)
#ref(0229_08.png,,30%)
*RとRstudioの導入 [#eed2f795]
実験に必要なRとRstudioの導入は下記のサイトを参考にして行...
https://www.tku.ac.jp/iss/guide/classroom/soft/rrstudio-d...
*潜在クラス分析(LPA) [#q4de3b9d]
①パッケージのインストール&br;
これはLPA.Rを先ほどダウンロードしたRstudio上で行う.~
プログラムを実行する前に,パッケージのインストールを行う.~
右下のPackagesの所から行う.~
#ref(0229_014.png,,30%)
左上のInstallを押すと,好きなPackagesをインストールするこ...
#ref(0229_015.png,,30%)
ライブラリのインストールの確認は以下のコードをconsoleに打...
>library()
インストールしたパッケージが完了していることが分かる.
#ref(0229_016.png,,30%)
②プログラムの変更部分&br;
・12行目:~
lca <- read.csv("C:/Users/towa/Labo2/数値実験結果/オー...
ファイルパスを自分のものに変更.~
・27行目:
cont_data <- dplyr::select(lca, x_1:y) #連続変数のみ
(lca, x_1:y)のx_1:yをx_1:x_13に変更(データが13個あるため).~
・36行目
mod <- mix(list(x_1~1, x_2~1, x_3~1, x_4~1, x_5~1, x_6~1...
y~1を消して,x_11~1,x_12~1,x_13~1を追加.(これもデータが13...
・39行目
nstates=5, # the number of latent classes
5から4に変更.(今回は4つのクラスに分けたいから).
・40行目
family=list(gaussian(),gaussian(),gaussian(),gaussian(),...
gaussian()の数を13個に増やす.~
・42行目
respstart=runif(110))
110から104に変更.(今回は104個の潜在クラスのどれに所属する...
・59行目
write.csv(posterior.states, "C:/Users/towa/Labo2/数値実...
データを入れたい場所を自分のものに指定.
#ref(0229_017.png,,30%)
③プログラムの実行&br;
Rstudioで実行を行う場合,実行したい範囲を選択して右上のRun...
今回はパラメータ数にペナルティを設けることでモデルの自由...
#ref(0229_09.png,,30%)
console上の結果は下記のようになる.
#ref(0229_010.png,,30%)
グラフはplots上に表示される.
#ref(0229_011.png,,30%)
次にモデルのフィット結果から得られる各対象が各潜在クラス...
そして,その結果を表示し,csvファイルに保存する.
#ref(0229_012.png,,30%)
console部分で最初の6つの観測に対して小数点以下4桁を四捨五...
#ref(0229_013.png,,30%)
その結果,4つのqに分けられた.
#ref(0229_024.png,,30%)
*RF6の実装 [#ueb83669]
実装は,RF6_real_experiment100.pyのプログラムを用いて行っ...
①実装を行う前の準備&br;
集めたデータの正規化を行う.
説明関数であるx_1からx_12については,すべての値を最大値で...
#ref(0229_025.png,,30%)
目的関数x_13については,z-scoreに変換する.~
変換の仕方は,https://statorials.org/ja/z%e3%82%b9%e3%82%b...
上のサイトを見て行った.
#ref(0229_026.png,,40%)
②プログラムのプログラムのプログラムの変更部分&br;
・169行目: ファイルパスを自分で収集したデータが入ったcsv...
#ref(0229_020.png,,45%)
・175行目: num_qの値を先ほど出した4に変更する.
#ref(0229_023.png,,60%)
・359行目: num_Rの値を5に変更する.
#ref(0229_021.png,,60%)
・640行目: if R==1:から下の部分をコメントアウトする.~
これと同様に,J=3,4,5も同じ操作を行う.
#ref(0229_022.png,,40%)
csvファイルの出力場所を指定する.
#ref(0229_027.png,,40%)
③出力結果&br;
csvファイルは,指定したフォルダに格納される.
#ref(0229_028.png,,30%)
*k-meansクラスタリング [#ha5a2e3d]
*式の出力 [#g1b4a88f]
終了行:
[[引き継ぎ(中島)]]
目次
#contents
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*目標 [#he736473]
データ数を2つ集め併せて計4つほど程度増やしてRF6.2で出力を...
*データの収集 [#tf106502]
統計で見る日本というサイトで,2020年の外国人数と小学校数(...
csvファイルをダウンロードする.
#ref(0229_02.png,,30%)
#ref(0229_03.png,,30%)
#ref(0229_04.png,,30%)
#ref(0229_05.png,,35%)
#ref(0229_06.png,,30%)
*使ったプログラムとデータ [#j6630b36]
#ref(RF6_real_experiment100.py,,RF6_real_experiment100.py)
#ref(data-city_num.csv,,data-city_num.csv)
#ref(open-data-20240220T010622Z-001.zip,,open-data-202402...
#ref(data-20240220T010624Z-001.zip,,data-20240220T010624Z...
#ref(LPA.R,,LPA.R)
#ref(k-means_0205_3.py,,k-means_0205_3.py)
*データの整理 [#r984c834]
ダウンロードしたopen-data-20240220T010622Z-001の中にあるo...
その際に,1741のデータから651のデータを抜き取ること.どのデ...
#ref(0229_07.png,,30%)
#ref(0229_08.png,,30%)
*RとRstudioの導入 [#eed2f795]
実験に必要なRとRstudioの導入は下記のサイトを参考にして行...
https://www.tku.ac.jp/iss/guide/classroom/soft/rrstudio-d...
*潜在クラス分析(LPA) [#q4de3b9d]
①パッケージのインストール&br;
これはLPA.Rを先ほどダウンロードしたRstudio上で行う.~
プログラムを実行する前に,パッケージのインストールを行う.~
右下のPackagesの所から行う.~
#ref(0229_014.png,,30%)
左上のInstallを押すと,好きなPackagesをインストールするこ...
#ref(0229_015.png,,30%)
ライブラリのインストールの確認は以下のコードをconsoleに打...
>library()
インストールしたパッケージが完了していることが分かる.
#ref(0229_016.png,,30%)
②プログラムの変更部分&br;
・12行目:~
lca <- read.csv("C:/Users/towa/Labo2/数値実験結果/オー...
ファイルパスを自分のものに変更.~
・27行目:
cont_data <- dplyr::select(lca, x_1:y) #連続変数のみ
(lca, x_1:y)のx_1:yをx_1:x_13に変更(データが13個あるため).~
・36行目
mod <- mix(list(x_1~1, x_2~1, x_3~1, x_4~1, x_5~1, x_6~1...
y~1を消して,x_11~1,x_12~1,x_13~1を追加.(これもデータが13...
・39行目
nstates=5, # the number of latent classes
5から4に変更.(今回は4つのクラスに分けたいから).
・40行目
family=list(gaussian(),gaussian(),gaussian(),gaussian(),...
gaussian()の数を13個に増やす.~
・42行目
respstart=runif(110))
110から104に変更.(今回は104個の潜在クラスのどれに所属する...
・59行目
write.csv(posterior.states, "C:/Users/towa/Labo2/数値実...
データを入れたい場所を自分のものに指定.
#ref(0229_017.png,,30%)
③プログラムの実行&br;
Rstudioで実行を行う場合,実行したい範囲を選択して右上のRun...
今回はパラメータ数にペナルティを設けることでモデルの自由...
#ref(0229_09.png,,30%)
console上の結果は下記のようになる.
#ref(0229_010.png,,30%)
グラフはplots上に表示される.
#ref(0229_011.png,,30%)
次にモデルのフィット結果から得られる各対象が各潜在クラス...
そして,その結果を表示し,csvファイルに保存する.
#ref(0229_012.png,,30%)
console部分で最初の6つの観測に対して小数点以下4桁を四捨五...
#ref(0229_013.png,,30%)
その結果,4つのqに分けられた.
#ref(0229_024.png,,30%)
*RF6の実装 [#ueb83669]
実装は,RF6_real_experiment100.pyのプログラムを用いて行っ...
①実装を行う前の準備&br;
集めたデータの正規化を行う.
説明関数であるx_1からx_12については,すべての値を最大値で...
#ref(0229_025.png,,30%)
目的関数x_13については,z-scoreに変換する.~
変換の仕方は,https://statorials.org/ja/z%e3%82%b9%e3%82%b...
上のサイトを見て行った.
#ref(0229_026.png,,40%)
②プログラムのプログラムのプログラムの変更部分&br;
・169行目: ファイルパスを自分で収集したデータが入ったcsv...
#ref(0229_020.png,,45%)
・175行目: num_qの値を先ほど出した4に変更する.
#ref(0229_023.png,,60%)
・359行目: num_Rの値を5に変更する.
#ref(0229_021.png,,60%)
・640行目: if R==1:から下の部分をコメントアウトする.~
これと同様に,J=3,4,5も同じ操作を行う.
#ref(0229_022.png,,40%)
csvファイルの出力場所を指定する.
#ref(0229_027.png,,40%)
③出力結果&br;
csvファイルは,指定したフォルダに格納される.
#ref(0229_028.png,,30%)
*k-meansクラスタリング [#ha5a2e3d]
*式の出力 [#g1b4a88f]
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![[PukiWiki]](image/pukiwiki.png "[PukiWiki]")
