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[[技術メモ]] -KGMLの解析にR言語がよく使われているようなので，R言語のメモを -対話モードのプログラム開発の方が便利だと思ったので，Jupyterで使います -Jupyter上への実装手順はこちら↓~ https://www.pu-toyama.ac.jp/IS/IIE/IIE.IS.20210325.toyama.pu/lab_log/wiki_lab.php?Jupyter%20Notebook%E9%96%A2%E9%80%A3#gd51845d ~ ~ *パッケージインストール方法(pipのようなもの) [#v4b0739d] ()内にパッケージ名を入れる(rを入れて対話モードにする) >install.packages("KEGGgraph") *各種パッケージ取得方法 [#c18dba2e] **KEGGgraph 下の方法だとエラー >source("https://bioconductor.org/biocLite.R") >biocLite("KEGGgraph") →Error: With R version 3.5 or greater, install Bioconductor packages using BiocManager; 正攻法 >if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") >BiocManager::install("KEGGgraph")
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[[技術メモ]] -KGMLの解析にR言語がよく使われているようなので，R言語のメモを -対話モードのプログラム開発の方が便利だと思ったので，Jupyterで使います -Jupyter上への実装手順はこちら↓~ https://www.pu-toyama.ac.jp/IS/IIE/IIE.IS.20210325.toyama.pu/lab_log/wiki_lab.php?Jupyter%20Notebook%E9%96%A2%E9%80%A3#gd51845d ~ ~ *パッケージインストール方法(pipのようなもの) [#v4b0739d] ()内にパッケージ名を入れる(rを入れて対話モードにする) >install.packages("KEGGgraph") *各種パッケージ取得方法 [#c18dba2e] **KEGGgraph 下の方法だとエラー >source("https://bioconductor.org/biocLite.R") >biocLite("KEGGgraph") →Error: With R version 3.5 or greater, install Bioconductor packages using BiocManager; 正攻法 >if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") >BiocManager::install("KEGGgraph")
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