R言語関連の変更点

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#author("2021-10-18T15:57:40+00:00","","")
#author("2021-10-18T15:59:51+00:00","","")
[[技術メモ]]


-KGMLの解析にR言語がよく使われているようなので，R言語のメモを
-対話モードのプログラム開発の方が便利だと思ったので，Jupyterで使います
-Jupyter上への実装手順はこちら↓~
https://www.pu-toyama.ac.jp/IS/IIE/IIE.IS.20210325.toyama.pu/lab_log/wiki_lab.php?Jupyter%20Notebook%E9%96%A2%E9%80%A3#gd51845d

~
~

*パッケージインストール方法(pipのようなもの) [#v4b0739d]
()内にパッケージ名を入れる(rを入れて対話モードにする)
 >install.packages("KEGGgraph")

*各種パッケージ取得方法 [#c18dba2e]
 **KEGGgraph
 下の方法だとエラー
 >source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
 >biocLite("KEGGgraph")
 →Error: With R version 3.5 or greater, install Bioconductor packages using BiocManager;

 正攻法
 >if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

     install.packages("BiocManager")
 >BiocManager::install("KEGGgraph")

R言語関連 の変更点