武藤さん修論_backup の履歴(No.1)

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  • 1 (2024-02-26 (月) 18:48:57)
  • 2 (2024-02-26 (月) 19:02:01)
  • 3 (2024-02-29 (木) 17:51:53)
  • 4 (2024-02-29 (木) 19:55:32)
  • 5 (2024-03-01 (金) 00:39:18)
  • 6 (2024-03-04 (月) 16:11:54)
  • 7 (2024-03-06 (水) 18:56:34)
  • 8 (2024-03-08 (金) 17:21:18)
  • 9 (2024-03-13 (水) 02:21:38)
  • 10 (2024-03-13 (水) 20:13:23)
  • 11 (2024-03-13 (水) 23:25:54)
  • 12 (2024-03-14 (木) 02:29:51)
  • 13 (2024-03-14 (木) 16:05:04)
  • 14 (2024-03-15 (金) 03:22:49)
  • 15 (2024-03-15 (金) 18:34:57)

技術資料

研究背景 

• 有機合成では効率性や環境面から化学反応の設計に生体触媒(酵素)が利用される機会が増加
  • 酵素は化学触媒よりも環境に優しく，特定の反応物に強く作用して化学反応を早く進める
• 酵素は4桁のEC番号で分類されている
• EC番号を機械学習で予測することで，酵素分析(以下)を行う実験コストや時間の削減になる
  • 代謝経路の解析で得られた未知の酵素の性質の特定()
  • 特定の化学反応を触媒する酵素の探索

環境構築 

anaconda rdkit専用チャネルの作成 

バージョン取得

python -V

rdkit チャネル作成

conda create -n rdkit python=X.X.X -y

※baseチャネルからrdkitチャネルに変更(Anaconda Prompt)

conda activate rdkit

rdkitライブラリの導入(pipでは不可)

conda install rdkit -c conda-forge

jupyterカーネル導入

pip install jupyter environment_kernels